ТКАНИННОСПЕЦИФІЧНІ РЕГУЛЯТОРНІ ЕФЕКТИ ГЕНА FGB (rs1800790) ПРИ COVID-19
DOI:
https://doi.org/10.24061/1727-4338.XXIV.4.94.2025.09Ключові слова:
COVID-19, локуси кількісних ознак експресії (eQTL), поліморфізм, ген, FGB (rs1800790)Анотація
Мета дослідження – вивчити транскрипційний вплив поліморфного варіанта промоторної ділянки гена FGB rs1800790 за допомогою аналізу локусів кількісних
ознак експресії з метою з’ясування його потенційної регуляторної ролі у
патофізіології COVID-19.
Матеріал і методи. Генотипування локусу FGB (rs1800790) проведено у 72-х
пацієнтів із середньо-тяжким і тяжким перебігом COVID-19 та у 48 пацієнтів
із легким перебігом захворювання. Критерієм включення у дослідження був
підтверджений лабораторно (за допомогою полімеразної ланцюгової реакції)
діагноз: COVID-19. Лабораторне обстеження, лікування та встановлення
діагнозу COVID-19 з урахуванням тяжкості перебігу здійснювали відповідно до
діючого Протоколу "Надання медичної допомоги для лікування коронавірусної
хвороби (COVID-19)" (наказами МОЗ України від 02.04.2020 року №762 в редакції
від 20.09.2021 року №1979) зі змінами і доповненнями (наказ МОЗ України від
17.05.2023 № 913) та рекомендацій ВООЗ, CDC та світових стандартів із
діагностики, лікування та профілактики COVID-19. Геномну ДНК екстрагували
з лейкоцитів периферичної крові, а алельну дискримінацію цільового SNP
виконували методом полімеразної ланцюгової реакції в реальному часі (RT-PCR).
Тканиноспецифічні транскрипційні ефекти варіанта FGB rs1800790 надалі
оцінювали за допомогою аналізу eQTL на основі загальнодоступних даних бази
QTLbase. Дослідження виконували з дотриманням основних положень Закону
України № 2801-XII «Основи законодавства України про охорону здоров’я», ICH
GСР (1996-2016 рр.), Гельсінської декларації Всесвітньої медичної асоціації про
етичні принципи проведення наукових медичних досліджень за участю людини
(1964-2013 рр.), Конвенції Ради Європи про права людини та біомедицину (від
04.04.1997 р.), наказу МОЗ України № 690 від 23.09.2009 р. (зі змінами, внесеними
згідно з Наказом Міністерства охорони здоров'я України № 523 від 12.07.2012 р.).
Отримано схвалення Комісії з питань біоетики Буковинського державного
медичного університету (протокол № 2 від 16.10.2025 р.). Письмова інформована
згода отримана від усіх учасників перед включенням до дослідження. Усі
статистичні аналізи проводили відповідно до сучасних стандартів біомедичних
досліджень із використанням програмного забезпечення Statistica 13.0 (StatSoft
Inc., США; ліцензія № JPZ804I382130ARCN10-J). Для оцінки відмінностей у
розподілі частоти генотипів використовували χ² (тест Пірсона). Значимість
відмінностей між незалежними вибірками з приблизно нормальним розподілом
оцінювали за допомогою t-тесту Стьюдента, тоді як для даних із ненормальним
розподілом застосовували U-тест Вілкоксона-Манна-Вітні. Статистичну
значущість приймали за значенням p < 0,05.
Результати. Картування виявило 25 eQTL, що демонструють цис-регуляторні
ефекти, тоді як транс-регуляторних асоціацій виявлено не було. Найбільш
статистично значущі транскрипційні ефекти варіанта FGB rs1800790 виявлені
на локусах, розташованих на хромосомі 4. Функціональний алель А
продемонстрував найсильнішу позитивну асоціацію з експресією гена FGG у
надниркових залозах, тоді як дещо нижчу, але все ще значно підвищену регуляцію
спостерігали в легеневій тканині. Навпаки, алель G пов'язаний із помірно
посиленою експресією в лімфоцитах. Крім того, алель A гена FGB rs1800790
продемонстрував позитивну регуляторну взаємодію з геном LRAT у тканині
вушка передсердя та iPSC.
Висновки. Виявлене підвищення експресії FGG та LRAT у легеневій і печінковій
тканинах, а також диференційовані патерни експресії у лімфоцитах і тканинах
шлунково-кишкового тракту засвідчують про багатогранну роль гена FGB у
регуляції коагуляції, запалення та ендотеліальної цілісності.
Посилання
Lai CC, Liu YH, Wang CY, Wang YH, Hsueh SC, Yen MY, et al.
Asymptomatic carrier state, acute respiratory disease, and
pneumonia due to severe acute respiratory syndrome coronavirus
(SARS-CoV-2): Facts and myths. J Microbiol Immunol Infect.
;53(3):404-12. doi: 10.1016/j.jmii.2020.02.012
Gelemanović A, Ćatipović Ardalić T, Pribisalić A, Hayward C,
Kolčić I, et al. Genome-Wide Meta-Analysis Identifies Multiple
Novel Rare Variants to Predict Common Human Infectious
Diseases Risk. Int J Mol Sci [Internet]. 2023[cited 2025 Dec
;24(8):7006. Available from:
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10138356/pdf/ijms-24-
pdf doi: 10.3390/ijms24087006
Sokolenko M, Sydorchuk L, Sokolenko A, Sydorchuk R, Kamyshna
I, Sydorchuk A, et al. Antiviral Intervention of COVID-19:
Linkage of Disease Severity with Genetic Markers FGB
(rs1800790), NOS3 (rs2070744) and TMPRSS2 (rs12329760).
Viruses [Internet]. 2025[cited 2025 Dec 09];17(6):792. Available
from:
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12197352/pdf/viruses17-00792.pdf doi: 10.3390/v17060792
Ministerstvo okhorony zdorov’ia Ukrainy. Protokol «Nadannia
medychnoï dopomohy dlia likuvannia koronavirusnoï khvoroby
(COVID-19)». Zatverdzheno Nakazom Ministerstva okhorony
zdorov’ia Ukrainy 02 kvitnia 2020 roku № 762 (u redaktsii nakazu
Ministerstva okhorony zdorov’ia Ukrainy 17 travnia 2023 roku №
[Protocol “Provision of medical care for the treatment of
coronavirus disease (COVID-19)”. Approved by Order of the
Ministry of Health of Ukraine dated April 2, 2020 № 762 (as
amended by Order of the Ministry of Health of Ukraine dated May
, 2023 № 913) ]. Kyiv: MOZ Ukrainy; 2023. 62 p. (in Ukrainian)
Center for Disease Control and Prevention. Prevention Actions to
Use at All COVID-19 Community Levels [Internet]. Center for
Disease Control and Prevention; 2023[cited 2025 Dec 11].
Available from: https://www.cdc.gov/covid/prevention/index.html
Sokolenko MO, Sydorchuk LP, Sokolenko LS, Sokolenko AA.
Zahal'na imunolohichna reaktyvnist' patsiientiv z COVID-19 ta yii
zv'iazok z polimorfizmom heniv, tiazhkistiu klinichnoho perebihu
zakhvoriuvannia ta poiednanniam iz suputnimy
zakhvoriuvanniamy [General immunologic reactivity of patients
with COVID-19 and its relation to gene polymorphism, severity of
clinical course of the disease and combination with comorbidities].
Medicni perspektivi. 2024;29(3):108-17. doi: 10.26641/2307-
2024.3.313570 (in Ukrainian)
Iba T, Levy JH, Connors JM, Warkentin TE, Thachil J, Levi M. The
unique characteristics of COVID-19 coagulopathy. Crit Care
[Internet]. 2020[cited 2025 Dec 11];24(1):360. Available from:
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7301352/pdf/13054_20
_Article_3077.pdf doi: 10.1186/s13054-020-03077-0
Connors JM, Levy JH. COVID-19 and its implications for
thrombosis and anticoagulation. Blood. 2020 Jun 4;135(23):2033-
doi: 10.1182/blood.2020006000
Simurda T, Brunclikova M, Asselta R, Caccia S, Zolkova J, Kolkova
Z, et al. Genetic Variants in the FGB and FGG Genes Mapping in
the Beta and Gamma Nodules of the Fibrinogen Molecule in
Congenital Quantitative Fibrinogen Disorders Associated with a
Thrombotic Phenotype. Int J Mol Sci [Internet]. 2020[cited 2025
Dec 09];21(13):4616. Available from:
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7369898/pdf/ijms-21-
pdf doi: 10.3390/ijms21134616
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2025 М.О. Соколенко, Л.П. Сидорчук
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
Часопис користується «Типовим шаблоном положення про авторські права».
