КОРОНАВІРУСНА ХВОРОБА COVID-19: НОВІ МОЖЛИВОСТІ ДІАГНОСТИКИ

Автор(и)

  • Л.І. Романчук
  • О.К. Колоскова
  • Т.М. Білоус
  • Р.В. Ткачук

DOI:

https://doi.org/10.24061/1727-4338.XXI.1.79.2022.11

Ключові слова:

коронавірус SARS CoV-2, діти, полімеразно-ланцюгова реакція, легеневий експірат, імуноглобуліни М, G, вірусне навантаження, вірусні цикли

Анотація

Мета роботи – визначити діагностичну доцільність використання конденсату
легеневого експірату в якості біосередовища по виявленню вірусу SARS-CoV-2
у хворих дітей коронавірусною хворобою COVID-19.
Матеріали та методи. Дослідження проводили на базі інфекційних відділень ОКНП
«Чернівецька дитяча обласна клінічна лікарня» згрудня 2021 року по січень 2022 року.
Верифікація коронавірусної хвороби COVID-19 відбувалась методом полімеразної
ланцюгової реакції (ПЛР) зі зворотною транскриптазою (набір COVID-19 Multiplex
RT-PCR у режимі реального часу від Labsystems DiagnosticsOy) з одночасним
виявленням трьох основних генів ORF1ab, оболонки (Е) та нуклеокапсиду (N).
Матеріалом для дослідження були мазки з носоглотки та легеневий експірат.
Результати. Ми обстежили 32 дітей, госпіталізованих із діагнозом COVID-19,
середній вік яких становив 10,43±0,72 (min=3, max=17). Питома частка хлопчиків
склала 34,4%, дівчаток – 64,6% (p=0,05), що свідчить про практичну відсутність
відмінностей за статевою ознакою. Забір біоматеріалу – мазки з носоглотки
та легеневий експірат, проводили на 6,71±0,58 (min=2, max=16) день захворювання.
У 46,8% пацієнтів було виявлено РНК вірусу SARS-CoV-2, що практично збігалося
з результатами ПЛР легеневого експірату 40,62% (p˃0,05). Оцінюючи вірусне
навантаження, середнє значення циклів для ПЛР-мазка з носоглотки становило
30,86±1,39, а для легеневого експірату – 32,39±1,26. Враховуючи середні показники,
залежно від виявленого гену, встановлено, що кількість циклів для гену Е мазка
становила 30,06±1,37 (min=19, max=38), гену N– 30,93±1,33 (min=20, max=38), гену
ORF1ab – 31,6±1,48 (min=20, max=40). Кількість циклів для гену Е конденсату –
32,6±1,24 (min=25, max=38); гену N – 33,36±1,09 (min=28, max=39), для ORF1ab –
34,08±1,06 (min=28, max=39).
Результати кореляційного аналізу показників параклінічного обстеження дітей,
госпіталізованих через коронавірусну хворобу COVID-19, показали зростання
ризику інфікування з показниками співвідношення шансів (OR) 2,27 (95% ДІ
1,26-4,08), відносним ризиком (RR) 1,47 (95% ДІ 1,01-2,15), абсолютним ризиком
(R) 0,20 при використанні ПЛР тесту мазка, порівняно з визначенням Ig M. При
отриманні позитивного результату тесту зростала посттестова імовірність
виявлення Ig M на 12,8%, при негативному – результат зменшувався на 7,5%.
Вірусне навантаження становило: для гену Е OR=2,8 (95%ДІ 1,58-4,98), RR=1,66
(95%ДІ 1,22-2,28), R=0,25, для генів N, ORF1ab OR=3,2 (95%ДІ 1,79-5,71), RR=1,77
(95%ДІ 1,29-2,44), R=0,28.
Висновки. 1. При порівняльному аналізі результатів ПЛР, проведених у різних
біосередовищах дітей, отримано дані, які свідчать про вищу специфічність
у виявленні збудника традиційного мазку зі слизової носоглотки порівняно
з використанням легеневого експірату.
2. Дослідження конденсату видихуваного повітря може бути використано з метою
скорочення терміну ізоляції пацієнтів.

Посилання

Cereda D, Tirani M, Rovida F, Demicheli V, Ajelli M, Poletti P, et

al. The early phase of the COVID-19 outbreak in Lombardy, Italy.

ArXiv[Internet].2020[cited 2022 Apr17];2003.0932v1. Available

from: https://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/2003/2003.09320.pdfdoi:

https://doi.org/10.48550/arXiv.2003.09320

Ng Y, Li Z, ChuaYX, ChawWL, ZhaoZ, ErB, etal. Evaluation of the

eff ectiveness of surveillance and containment measures for the fi rst

patients with COVID-19 in Singapore – January 2 – February

, 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2020;69:307-11.doi:

http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm6911e1

Gudbjartsson DF, Helgason A, Jonsson H, Magnusson OT, Melsted

P, Norddahl GL, et al. Spread of SARS-CoV-2 in the Icelandic

Population. N Engl J Med.2020;382:2302-15. doi: http://dx.doi.

org/10.1056/NEJMoa2006100

Deckert A, Anders S, de Allegri M, Nguyen HT, Souares A, McMahon

S, et al. Eff ectiveness and cost-eff ectiveness of four diff erent strategies

for SARS-CoV-2 surveillance in the general population (CoV-Surv

Study): a structured summary of a study protocol for a cluster-

randomised, two-factorial controlled trial. Trials[Internet].2021[cited

Apr15];22(1):39. Available from: https://trialsjournal.

biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13063-020-04982-z.pdfdoi:

http://dx.doi.org/10.1186/s13063-020-04982-z

Chen Y, Huang S, Zhou L, Wang X, Yang H, Li W. Coronavirus

Disease 2019 (COVID-19): Emerging detection technologies and

auxiliary analysis. J Clin Lab Anal[Internet]. 2022[cited 2022

Apr11];36(1): e24152. Available from: https://www.ncbi.nlm.

nih.gov/pmc/articles/PMC8761422/pdf/JCLA-36-e24152.pdfdoi:

https://doi.org/10.1002/jcla.24152

Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu

DKw, et al. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)

by real-time RT-PCR. Euro Surveill[Internet].2020[cited 2022

Apr17];25(3):2000045. Available from: https://www.ncbi.nlm.

nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/pdf/eurosurv-25-3-5.pdfdoi:

https://doi.org/10.2807/1560-7917.es.2020.25.3.2000045

Al Bayat S, Mundodan J, Hasnain S, Sallam M, Khogali H, Ali D, et

al. Can the cycle threshold (Ct) value of RT-PCR testfor SARS CoV2

predict infectivity among close contacts? J Infect Public Health.

;14(9):1201-5. doi: https://doi.org/10.1016/j.jiph.2021.08.013

Health Strategic Command Group, Qatar. Revised policy on use

of PCR test Ct values for admission and discharge from isolation

facilities. HMC Reference. 2020; CI 001190620.

Abbott S, Hellewell J, Thompson RN, Sherratt K, Gibbs HP, Bosse

NI, et al. Estimating the time-varying reproduction number of

SARS-CoV-2 using national and subnational case counts [version

; peer review: 1 approved with reservations].Wellcome Open

Res[Internet].2020[cited 2022 Apr15];5:112. Available from:

https://wellcomeopenresearch.org/articles/5-112doi: http://dx.doi.

org/10.12688/wellcomeopenres.16006.2

He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, et al. Temporal

dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat

Med.2020;26:672-5.doi: https://doi.org/10.1038/s41591-020-0869-5

Ryan DJ, Toomey S, Madden SF, Casey M, Breathnach OS,

MorrisPG, et al. Use of exhaled breath condensate (EBC) in the

diagnosis ofSARS-COV-2 (COVID-19). Thorax. 2021;76(1):86-8.

doi: https://doi.org/10.1136/thoraxjnl-2020-215705

Bullard J, Dust K, Funk D, Strong JE, Alexander D, Garnett L,

et al. Predicting infectious Severe Acute Respiratory Syndrome

Coronavirus 2 from diagnosticsamples. ClinInfect Dis.

;71(10):2663-6. doi: https://doi.org/10.1093/cid/ciaa638

La Scola B, Le Bideau M, Andreani J, Hoang VT, Grimaldier C, Colson P,

et al. Viral RNA load as determined by cell culture as a managementtool

for discharge of SARS-CoV-2 patients from infectious disease wards.

Eur J Clin Microbiol InfectDis. 2020;39(6):1059-61. doi: https://doi.

org/10.1007/s10096-020-03913-9

Keeling MJ, Hollingsworth TD, Read JM. Effi cacy of contact

tracing for the containment of the 2019 novel coronavirus

(COVID-19).J Epidemiol Community Health.2020;74(10):861-6.

doi: https://doi.org/10.1136/jech-2020-214051

La Scola B, Le Bideau M, Andreani J, Hoang VT, Grimaldier C, Colson

P, et al. Viral RNA load as determined by cell culture as a management

tool for discharge of SARS-CoV-2 patients from infectious disease

wards. Eur J Clin Microbiol Infect Dis.2020;39(6):1059-61. doi:

https://doi.org/10.1007/s10096-020-03913-9

##submission.downloads##

Опубліковано

2022-06-21

Номер

Розділ

Статті